Sembla que Ubuntu fa que s'aturi la comprovació i es demani la intervenció de l'usuari (que normalment consisteix en prémer la tecla per provar de fer la reparació automàtica).
En fi, per evitar que això torni a passar, cal editar un fitxer de configuració i posar l'opció FSCKFIX=yes:
$ sudo nano /etc/default/rcS
Amb això ja arrencarà sense problemes la propera vegada que passi. A menys que hi hagi un problema gros de veritat, es clar !